常規清潔方法

去除內部物品并排水

首先要把細胞培養箱里的東西全部取出，放盡培養箱里的水（如三蒸水等）。然后可以用純水或蒸餾水對培養箱內部進行多次沖洗，這有助于去除殘留的培養基、細胞碎片等雜質。

擦拭內壁

酒精擦拭：

可以使用75%酒精對培養箱內壁進行擦拭，這是比較常用的方法。有的實驗室會擦拭3遍，擦拭過程中要注意不要遺漏任何角落。擦拭后可以通風10分鐘左右，讓酒精揮發干凈，避免對后續培養產生影響。

也有使用70%乙醇進行擦洗的情況，之后還可以再用0.1%的新潔爾滅擦洗，如果不放心還可以再用高錳酸鉀加甲醛1:1比例熏一遍，但要注意甲醛熏蒸后要充分通風散味，因為甲醛有毒且會影響細胞生長，熏蒸后至少要一個星期才可以讓甲醛散盡，否則細胞長不好。

其他清潔劑擦拭：

可以先用洗衣粉或洗潔精洗一遍，再用清水沖凈，接著用84消毒液洗，最后再用清水沖凈，之后再用75%酒精擦洗一遍。

還有實驗室用抹布蘸取滴有清潔劑（如洗潔精等）的飲用水擦拭培養箱內部。

消毒方法

紫外線照射

在清潔完畢后，可以使用紫外線進行照射消毒。如果培養箱自帶紫外線功能比較方便，直接開啟照射即可。如果是使用可移動的紫外燈，在酒精擦拭通風后，可以將其放入培養箱內照射30分鐘 - 4小時不等，有的實驗室照射30分鐘，有的則照射4小時以上。在使用紫外線照射時要注意保護好自己的眼睛和皮膚，避免紫外線傷害。

熏蒸消毒

可以采用高錳酸鉀加甲醛1:1比例熏一遍的方法，但這種方法要特別注意安全。混合后要馬上離開，然后密閉細胞培養室，因為甲醛氣味很刺激且有毒。熏蒸后要充分通風散味，至少需要一個星期的時間才能讓甲醛散盡，以免影響細胞生長。

高溫消毒（部分培養箱適用）

有的培養箱能加熱內壁到90度，可利用此功能進行高溫消毒，不過這種方法要參考培養箱的手冊，確保高溫不會對培養箱內的其他部件（如傳感器等）造成損壞。

化學試劑抑菌

在培養箱的水里加上亞甲基藍，混勻，亞甲基藍溶液可起到一定的抑菌滅菌作用。不過在使用化學試劑時要注意，不要使用腐蝕性的消毒劑或有機溶劑，因為培養箱內有檢查溫度、濕度和二氧化碳濃度的傳感器等部件，這些腐蝕性物質可能會損壞某些器件。

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