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什么是微流控PCR芯片

基因(遺傳因子)是產(chǎn)生一條多肽鏈或功能RNA所需的全部核苷酸序列。基因支持著生命的基本構(gòu)造和性能。儲(chǔ)存著生命的種族、血型、孕育、生長、凋亡等過程的全部信息。PCR技術(shù)是基因研究的重要手段之一,但傳統(tǒng)PCR技術(shù)存在反應(yīng)時(shí)間長、能量消耗大、不便于集成與攜帶等缺陷,微流控技術(shù)與PCR結(jié)合可以有效縮小反應(yīng)體系,提高反應(yīng)效率,且易于集成化與微型化。

本文采用【圖解】的方式,講解微流控PCR芯片的分類,原理以及應(yīng)用。幫助大家了解認(rèn)識(shí)微流控PCR芯片技術(shù),并在各自研究領(lǐng)域應(yīng)用微流控PCR技術(shù)。

什么是PCR

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聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(英文:Polymerase chain reaction,縮寫:PCR),是一種分子生物學(xué)技術(shù),用于擴(kuò)增特定的DNA片段,這種方法可在生物體外進(jìn)行,不必依賴大腸桿菌或酵母菌等生物體。PCR過程包括3個(gè)步驟: 變性、退火、延伸,需要在高低中3個(gè)不同的溫度(高溫變性:90℃~95℃,低溫退火:55℃~60℃;中溫延伸:70℃~72℃)下進(jìn)行。

微流控PCR芯片

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Kopp設(shè)計(jì)的世界上第一款微流控PCR裝置

微流控PCR芯片,是基于微流控技術(shù)的PCR反應(yīng)裝置。微流控裝置體積小巧,樣本需求小,成本低,利于現(xiàn)場實(shí)時(shí)檢測;并且具有小的熱質(zhì),低的熱慣性和快速的熱傳遞,以及巨大的比表面積,可以顯著提高擴(kuò)增速度。同時(shí),具有高度集成性,全封閉性,可以減少手工操作,有效避免樣本污染。

微流控PCR芯片分類

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空間型:流體在微通道運(yùn)動(dòng),溫度區(qū)域固定

時(shí)間型:流體在微通道不動(dòng),通道內(nèi)溫度變化

LAMP芯片: 恒溫?cái)U(kuò)增,擴(kuò)增過程無需溫度變化

數(shù)字PCR:核酸分子絕對(duì)定量技術(shù)。將樣品稀釋到單分子水平,并平均分配到幾十至幾萬個(gè)單元中進(jìn)行反應(yīng),在擴(kuò)增結(jié)束后對(duì)每個(gè)反應(yīng)單元的熒光信號(hào)進(jìn)行采集,最后通過直接計(jì)數(shù)或泊松分布公式計(jì)算得到樣品的原始濃度或含量。

微流控PCR空間型-蛇形式

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采用三塊銅片作為加熱器的蛇形微流控PCR芯片

微流控PCR空間型-輻射式

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一種由太陽能驅(qū)動(dòng)的便攜式PCR裝置,采用輻射式圓盤作為PCR芯片,圓盤的徑向三個(gè)區(qū)域溫度不同。擴(kuò)增數(shù)據(jù)無線傳輸?shù)狡桨咫娔X進(jìn)行分析。

微流控PCR空間型-螺旋式

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Park 等將一條長3.5m的彈性石英管在有3個(gè)溫區(qū)的圓柱加熱器上螺旋式纏繞33周,實(shí)現(xiàn)了PCR擴(kuò)增。其中a為變性區(qū),b為退火區(qū),c為延伸區(qū),d為絕熱區(qū)。

微流控PCR空間型-振蕩式

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微流體通道內(nèi)的振蕩液滴示意圖。樣品液滴在三個(gè)不同的加熱器之間振蕩移動(dòng),用于變性(a),退火(b)和延伸(c),第二個(gè)PCR循環(huán)(d-f)

微流控PCR空間型-閉環(huán)式

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Sun 團(tuán)隊(duì)將多個(gè)閉環(huán)通道合并在一塊芯片內(nèi),利用中心的磁鐵同時(shí)對(duì)四重閉環(huán)內(nèi)的磁性流體進(jìn)行操縱,磁性流體繼而推動(dòng)反應(yīng)液在環(huán)內(nèi)流動(dòng),循環(huán)通過 3 個(gè)溫區(qū)。

微流控PCR時(shí)間型-集成式

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Manage等制作的集成式微流控PCR芯片,可以對(duì)全血樣本檢測處理。與PCR腔室相鄰的是微流控閥,可以泵送流體。擴(kuò)增完成后,該裝置可以使用毛細(xì)管電泳分離PCR產(chǎn)物。

微流控PCR時(shí)間型-離心式

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左圖為存儲(chǔ)試劑的微流控盤片(GeneSlice)和右圖兼容轉(zhuǎn)子架(Rotor),可以容納四個(gè)微流控盤片運(yùn)行。GeneSlice包括樣品預(yù)擴(kuò)增室,用于轉(zhuǎn)移預(yù)擴(kuò)增產(chǎn)物的毛細(xì)管虹吸閥,用于樣品等分結(jié)構(gòu)室,等分結(jié)構(gòu)將多余的液體引導(dǎo)到廢物室,用于壓力均衡的通氣孔膜覆蓋。所有需要的試劑都以凍干或風(fēng)干形式預(yù)先儲(chǔ)存。

微流控LAMP芯片

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Fang等采用PDMS和玻璃制成的微流控LAMP芯片,用于多種基因分析。該芯片由10個(gè)微腔體,以及相互連接的微通道構(gòu)成。

微流控?cái)?shù)字PCR芯片

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Song等設(shè)計(jì)的具有蛇形通道的數(shù)字PCR芯片,該芯片包括反應(yīng)室和分支通道。a,第一步樣品(紅色染料)流過真空的PDMS裝置;b,反應(yīng)室充滿樣品;c,試用油流過微通道;d,將樣品分成單個(gè)體積。形成的獨(dú)立的腔室,經(jīng)過擴(kuò)增后,通過數(shù)字處理方式,對(duì)擴(kuò)增結(jié)果進(jìn)行分析。

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